A Madárgyűjtemény a hazai madártani kutatás, ismeretterjesztés és oktatás megkerülhetetlen intézménye. A gyűjtemény 1956-ban megsemmisült, mai anyaga az azóta eltelt évtizedek során gyűlt össze. Több mint 1600 faj 22 ezer példányát őrzi. A teljes alakos preparátumok száma 2350 feletti.
Tudományos anyaga elsősorban a Kárpát-medencei madárfauna elterjedésének, fajösszetételének lenyomatát őrzi, a négyezer feletti fészekalj a fajok hazai fészkelését, azaz megtelepedésüket és jelenlétüket is bizonyítja. Az érintetlen élőhelyeken és a városi faunában egyaránt megfigyelhető madarak lenyűgöző megjelenésükkel az ismeretterjesztés remek eszközei, a madárpreparátumok az állandó és időszaki kiállítások gyakori kellékei. A gyűjteményben folyó oktatási tevékenység az általános iskolai és a középiskolai csoportok fogadásától a nyári táborokon át az egyetemi képzésig, madárgyűrűző- és vadászvizsgákig széles skálán zajlik.
