A gyűjtemény a történelmi Magyarország, illetve a Kárpát-medence és a Kárpátok területén gyűjtött virágos növények szárított, konzervált herbáriumi példányait őrzi és dokumentálja.
Jelenleg mintegy 750 000 lapot számlál, a Kárpát-medencében a legfontosabb herbárium a térség virágos flóráját kutató szakemberek számára. Elsősorban növényrendszertani, növényföldrajzi és természetvédelmi vizsgálatokhoz biztosít összehasonlító anyagot. Ide tartoznak a legrégibb virágos gyűjtemények, amelyeket a 18. században, illetve a 19. század első felében élt botanikusok gyűjtöttek, valamint a hazai flóra fajainak csíranövényeit és magoncait bemutató gyűjtemény.
